Fiji: Image Processing for Biotechnology and Toxicology Training Cursus

Inleiding tot Image Processing for Biotechnologie en Toxicologie en ImageJ

• Overzicht van Image Processing for Biotechnologie en Toxicologie en zijn toepassingen in wetenschappelijk onderzoek
• Begrijpen van de architectuur van ImageJ en plugins
• Installeren en instellen van Image Processing for Biotechnologie en Toxicologie voor optimale prestaties

Basisimageverwerkingstechnieken

• Beeldverzameling en importformaten
• Aanpassen van contrast, helderheid en filters toepassen
• Beeldstapeling en projectiemethoden

Geavanceerde Beeldverwerking

• Segmentatietechnieken: drempelwaardebepaling en randdetectie
• Objecttelling en deeltjeanalyse in histologische monsters
• Meten van oppervlakten, omtrekken en andere morfologische kenmerken

Werken met Histologische Monsters

• Verwerken van beelden van histologische weefsels, bloedcellen en algen
• Kleurafsplitsing en analyse van gekleurde weefsels
• Tijdsverloopanalyse en het volgen van celbeweging

Automatisering en Aangepaste Oplossingen

• Het maken en uitvoeren van macros voor herhalende taken
• Gebruik van Image Processing for Biotechnologie en Toxicologie-plugins voor gespecialiseerde analyses
• Basis-scripting met ImageJ Macro Language (IJM)

Rapportage en Presentatie

• Exporteren van resultaten en het genereren van rapporten
• Annoteren van beelden en het voorbereiden van gegevens voor publicatie
• Beste praktijken voor herhaalbare beeldanalyse

Samenvatting en Volgende Stappen