Cursusaanbod

Inleiding tot Fiji en ImageJ

  • Overzicht van Fiji en zijn toepassingen in wetenschappelijk onderzoek
  • Begrip van ImageJ’s architectuur en plugins
  • Installeren en instellen van Fiji voor optimale prestaties

Basisafbeeldingverwerkings technieken

  • Afbeeldingsopname en invoerformaten
  • Contrast, helderheid aanpassen en filters toepassen
  • Afbeeldingstacking en projectie-methoden

Geavanceerde afbeeldingsanalyse

  • Segmentatietechnieken: drempelwaarde en randdetectie
  • Objecttelling en deeltjesanalyse in histologische monsters
  • Oppervlak, omtrek en andere morfologische kenmerken meten

Werken met biologische monsters

  • Afbeeldingen van histologische weefsels, bloedcellen en algen verwerken
  • Kleurdeconvolutie en analyse van gekleurde weefsels
  • Time-lapse-analyse en celbeweging volgen

Automatisering en aanpassing

  • Macros maken en uitvoeren voor herhaalde taken
  • Fiji-plugins gebruiken voor gespecialiseerde analyses
  • Basis scripten met de ImageJ Macro Language (IJM)

Datamanagement en rapportage

  • Resultaten exporteren en rapporten genereren
  • Afbeeldingen annoteren en data voorbereiden voor publicatie
  • Best practices voor reproduceerbare afbeeldingsanalyse

Samenvatting en volgende stappen

Vereisten

  • Basiskennis van biologische afbeeldingsconcepten
  • Vertrouwdheid met microscopie en histologische technieken
  • Basisvaardigheden in computergebruik

Doelgroep

  • Onderzoekers in biotechnologie en milieu-toxicologie
  • Laboratoriumtechnici die werken met histologische en cellulaire afbeeldingen
  • Wetenschappers geïnteresseerd in kwantitatieve afbeeldingsanalyse
 14 uren

Aantal deelnemers


Prijs per deelnemer

Voorlopige Aankomende Cursussen

Gerelateerde categorieën